На выставке Storage Networking World 2006 компания Microsoft сообщила, что специализированная операционная система Windows Storage Server 2003 R2 доступна у официальных OEM-партнеров компании.

Ввиду того, что Windows Storage Server 2003 R2 унаследовала многие черты Windows Server 2003 R2, так как построена на ее основе. Добавились новые средства управления, поддержка виртуализации и новые возможности хранения данных (управление файлами, находящимися в открытом доступе). Упрощена работа в сетях SAN (storage area networks): централизованное управление, управление iSCSI-устройствами. Добавлен компонент Network Access Protection, представляющий собой набор инструментов для обеспечения сетевой безопасности. Программная платформа доступна в как 32-битной, так и в 64-битной модификации. Улучшены средства взаимодействия с Unix-системами, добавлены функции Client Inspection and Isolation (проверка конфигурации подключаемых к сети компьютеров на обновление).

Серверы на основе Windows Storage Server 2003 R2 начинают поставлять такие компании, как Dell, Hewlett-Packard и IBM.